Communauté scientifique de Montpellier



Biologie et génétique des interactions plantes/pathogènes (BGPI)

Directeur: Jean-Loup Nottéghem
Thématique de recherche
L'UMR Biologie et génétique des interactions plantes/pathogènes pour la protection intégrée (BGPI), vise à mieux connaître la biologie et la dynamique des populations de quelques pathogènes ou mauvaises herbes en vue de proposer une lutte raisonnée, selon trois axes : systématique, phylogénie, phylogéographie ; génétique et écologie des populations ; écologie intégrative des systèmes populations-environnement.
Personnel
Agents permanents
Chercheurs*
Chercheurs avec HDR [1]
Post-doctorants
Doctorants
80
32
5
4
8
*Répartition des chercheurs par institut : 20 CIRAD, 8 INRA, 3 SupAgro, 1 CNRS
[1] HDR : habilitation à diriger des recherches
Equipes de recherche
Equipe 1 - Détection, variabilité et expression des Badnavirus endogènes et exogènes: L'équipe s'intéresse à la biodiversité du genre badnavirus afin d'avoir des éléments sur la structuration des populations virales, nécessaires au traitement des questions liées au développement et au contrôle d'épidémies naturelles quelle qu'en soit l'origine virale, exogène ou endogène. Trois axes de recherche ayant trait à la biodiversité ont ainsi été étudiés au travers de deux modèles : le Cacao swollen shoot virus sur le cacaoyer pour les épidémies naturelles et le virus de la mosaïque en tirets du bananier pour les épidémies d'origine endogène.
Equipe 2 - Caulimoviridae & Geminiviridae - Transmission & Evolution (CaGeTE) : L'équipe CaGeTE s'intéresse à l'impact des mécanismes de l'interaction virus-vecteur sur l'évolution des populations virales. Nous développons une approche pluridisciplinaire qui va de la biochimie structurale des protéines du virus et du vecteur, en passant par la biologie cellulaire des interactions virus-hôte, jusqu'à la génétique des populations virales.
Equipe 3 - Génomique et analyse moléculaire de la pathogénie des bactéries phytopathogènes: Les objectifs sont l'analyse de la diversité génétique des populations de bactéries phytopathogènes et l'étude des mécanismes moléculaires qui confèrent aux bactéries la pathogénie envers les plantes, afin de développer de nouvelles méthodes de lutte. Deux bactéries, Xanthomonas albilineans et Xanthomonas arboricola pv. pruni, constituent actuellement nos modèles d'étude.
Equipe 4 - Interactions riz-parasites: Un des objectifs de l'équipe est de mieux comprendre les phénomènes de contournement des résistances spécifiques. Les études réalisées portent sur la caractérisation génétique et moléculaire des interactions Riz-M. grisea et sur l'évolution des populations de l'agent pathogène. Ces travaux sont appliqués à la sélection pour une résistance durable. En ce qui concerne la caractérisation génétique des mécanismes de défense du riz, les objectifs sont d'établir des liens fonctionnels entre différentes formes de résistance, d'identifier des régulateurs des réactions de défense du riz, d'évaluer l'origine et l'amplitude de la diversité des réactions de défense et d'établir une carte physique de l'arsenal de défense du riz.
Equipe 5 - Biologie et évolution de champignons phytopathogènes: Comprendre la biologie évolutive des populations d'agents pathogènes pour optimiser les méthodes de lutte en privilégiant la résistance variétale des plantes. La diversité des populations et leur capacité d'évolution sous l'effet de différents processus évolutifs (sélection, migration, mutation, recombinaison) sont appréhendées pour différents modèles biologiques. Ces travaux sont déterminants pour élaborer des modèles prédictifs d'évolution des populations, pour optimiser les programmes d'amélioration génétique et les stratégies d'utilisation de la résistance variétale dans le temps et dans l'espace.
Equipe 6 - Epidémiologie des maladies transmises par vecteurs sur plantes pérennes: Les objectifs sont de caractériser les populations qui composent le pathosystème (agent pathogène, vecteurs, réservoirs de l'agent pathogène et des vecteurs, plantes cultivées sensibles), d'identifier et quantifier les processus relatifs aux interactions entre ces populations et de tester des hypothèses afin de comprendre le fonctionnement du pathosystème d'un point de vue dynamique. Les échelles d'étude vont de la plante (niveau de caractérisation des populations de l'agent pathogène) au territoire régional (niveau de compréhension de la dynamique du pathosystème sous l'action de ses vecteurs et des activités humaines).
Equipe 7 - Transfert, diagnostic, quarantaine: Les activités de l'équipe constituent le domaine d'application de l'UMR et impliquent une interface importante de la recherche avec la profession et le terrain. Ces activités permettent la production et l'échange de matériel végétal sain et performant dans l'optique de la mission de quarantaine qui, selon les besoins, comporte divers processus : indexation de maladies (canne à sucre, bananier, igname), centre de transit (canne à sucre, igname), assainissement (canne à sucre, igname). Les méthodes de diagnostic utilisées font appel à une large gamme de techniques, les techniques moléculaires jouant un rôle de plus en plus important.
Plateformes et autres outils
  • Serres de quarantaine niveau 2 : 400 m²
  • Chambres de croissance en quarantaine niveau 3 : 5 x 15 m2
  • Microscopie électronique
Principaux partenariats internationaux
  • Université de Floride, Département de pathologie végétale, Gainesville
  • PPT Lodi, Italie
  • Université de Glasgow, Département environnement et évolution
  • ENA Meknes, laboratoire de virologie
  • Faits et chiffres
Publications dans des revues internationales
2007: 20
2006: 15
2005: 17

Publications significatives
Uzest M., Gargani D., Drucker M., Hébrard E., Garzo E., Candresse T., Fereres A., Blanc S. 2007. A protein key to plant virus transmission at the tip of the insect vector stylet. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 104 (46): 17959-17964
Jridi C., Martin J.F., Marie-Jeanne V., Labonne G., Blanc S. 2006. Distinct viral Populations differentiate and evolve independently in a single perennial host plant. Journal of Virology, 80 (5): 2349-2357
Vivien E., Pitorre D., Cociancich S., Pieretti I., Gabriel D.W., Rott P.C., Royer M. 2007. Heterologous Production of Albicidin: a promising approach to overproducing and characterizing this potent inhibitor of DNA gyrase. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 51 (4): 1549-1552
Ballini E., Berruyer R., Morel J.-B., Lebrun M.-H., Nottéghem J.-L., Tharreau D. 2007. Modern elite rice varieties of the 'Green Revolution' have. retained a large introgression from wild rice around the Pi33 rice blast resistance locus. New Phytologist, 175 (1): 340-350
Thébaud G., Sauvion N., Chadoeuf J., Dufils A., Labonne G. 2006. Identifying risk factors for European stone fruit yellows from a survey. Phytopathology, 96 (8): 890-899.
Hohn T., Richert-Pöggeler K., Staginnus C., Harper G., Schwarzacher T., How Teo C.,
Teycheney P.Y., Iskra-Caruana M.L., Hull R. 2007. Evolution of integrated plant viruses. M. Roosinck ed., Springer in "Plant virus evolution"