Communauté scientifique de Montpellier



Démarche intégrée pour comprendre les interactions insectes ravageurs – auxiliaires de culture (DGIMI)

Directeur: Patrick Taillez
tailliez@univ-montp2.fr
Thématique de recherche
Les activités de l'UMR Démarche intégrée pour comprendre les interactions insectes ravageurs - auxiliaires de culture sont axées sur les interactions entre les ravageurs et leurs ennemis naturels. L'unité mène des travaux sur les insectes ravageurs des cultures (Lepidoptera) et leur génomique, leurs bio-agresseurs (bactéries, virus, nématodes et parasitoïdes), leurs génomes et de leur diversité ainsi que les mécanismes d'interaction entre ces deux partenaires (facteurs de virulence des agents pathogènes et mécanismes de défense des insectes). Les activités de l'Unité impliquent différents niveaux d'études depuis les gènes jusqu'à l'organisme entier, comprenant les aspects populationnels, en collaboration avec des laboratoires tels que CBGP et BGPI. Les recherches comprennent différentes approches ciblant les gènes et leurs régulateurs (virulence par exemple) ainsi que des approches globales (-omique), et intègrent de plus en plus les aspects de la modélisation appliquée aux réseaux de régulation génétique, à la dynamique des populations et aux interactions entre les populations de prédateurs et de proies, en collaboration avec des laboratoires spécialisés. Ces études bénéficient également des travaux de l'Unité sur la diversité et l'évolution des insectes pathogènes et sur les génomes des partenaires impliqués dans l'interaction (ainsi, un génome de lépidoptère est actuellement sous séquençage et plusieurs génomes bactériens ou polydnaviraux ont été séquencés récemment au Génoscope).

Personnel
Institution Chercheurs Professeurs Ing. de recherche Personnel Adm. et Techn. Doct.
UM2 - INRA
9
7
1
20
7
Equipes de recherche
- Epigénétique, holocentrisme et adaptation des insectes
- Génomes fonctionnels et facteurs de virulence bactérienne
- Dynamique des interactions densovirus-insectes
- Ressources biologiques et génétiques des bactéries et des nématodes entomopathogènes
- Biologie intégrative des interactions hôte-parasitoïde
Plateformes et autres outils
- QIPBCA (Plate-forme de quarantaine d'insectes pour des essais de lutte biologique)
- SPODOBASE (l'une des plus grandes bases de données EST pour une noctuelle accessible à toute la communauté scientifique)
- Une ressource BAC de haute qualité (taille moyenne des inserts 125 ko, couverture 10X) réalisée pour une noctuelle
- Un insectarium respectant les normes NS2
Principaux partenariats internationaux
USA, Brésil, UK, Liban, Chine, Japon, Australie, Pays de la Méditerranée
Faits et chiffres
Publications dans des revues internationales
2005 - 2009: 79
Publications significatives
1. Provost B, Jouan V, Hilliou F, Delobel P, Bernardo P, Ravallec M, Cousserans F, Wajnberg E, Darboux I, Fournier P, Strand MR, Volkoff AN. 2011. Lepidopteran transcriptome analysis following infection by phylogenetically unrelated polydnaviruses highlights differential and common responses. Insect Biochem Mol Biol. 41:582-91.

2. Aymeric JL, Givaudan A, Duvic B. Imd pathway is involved in the interaction of Drosophila melanogaster with the entomopathogenic bacteria, Xenorhabdus nematophila and Photorhabdus luminescens. Mol Immunol. 2010. 47:2342-8. Epub 2010 Jun 2. PubMed PMID: 20627393.

3. Costa SC, Varela Chavez C, Jubelin G, Givaudan A, Escoubas JM, Brehélin M, Zumbihl R. Recent insight into the pathogenicity mechanisms of the emergent pathogen Photorhabdus asymbiotica. Microbes Infect. 2010. 12:182-9.

4. d'Alençon E, Sezutsu H, Legeai F, Permal E, Bernard-Samain S, Gimenez S, Gagneur C, Cousserans F, Shimomura M, Brun-Barale A, Flutre T, Couloux A, East P, Gordon K, Mita K, Quesneville H, Fournier P, Feyereisen R. Extensive synteny conservation of holocentric chromosomes in Lepidoptera despite high rates of local genome rearrangements. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010. 107:7680-5.

5. Mutuel D, Ravallec M, Chabi B, Multeau C, Salmon JM, Fournier P, Ogliastro M. Pathogenesis of Junonia coenia densovirus in Spodoptera frugiperda: a route of infection that leads to hypoxia. Virology. 2010. 403:137-44.

6. Ogier JC, Calteau A, Forst S, Goodrich-Blair H, Roche D, Rouy Z, Suen G, Zumbihl R, Givaudan A, Tailliez P, Medigue C, Gaudriault S. Units of plasticity in bacterial genomes: new insight from the comparative genomics of two bacteria interacting with invertebrates, Photorhabdus and Xenorhabdus. BMC Genomics. 2010. 11:568. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 20950463.

7. Tailliez P, Laroui C, Ginibre N, Paule A, Pagès S, Boemare N. Phylogeny of Photorhabdus and Xenorhabdus based on universally conserved protein-coding sequences and implications for the taxonomy of these two genera. Proposal of new taxa: X. vietnamensis sp. nov., P. luminescens subsp. caribbeanensis subsp. nov., P. luminescens subsp. hainanensis subsp. nov., P. temperata subsp. khanii subsp. nov., P. temperata subsp. tasmaniensis subsp. nov., and the reclassification of P. luminescens subsp. thracensis as P. temperata subsp. thracensis comb. nov. Int J Syst Evol Microbiol. 2010. 60:1921-37.

8. Varela Chavez C, Jubelin G, Courties G, Gomard A, Ginibre N, Pages S, Taïeb F, Girard PA, Oswald E, Givaudan A, Zumbihl R, Escoubas JM. The cyclomodulin Cif of Photorhabdus luminescens inhibits insect cell proliferation and triggers host cell death by apoptosis. Microbes Infect. 2010. Sep 24. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 20870031.

9. Volkoff AN, Jouan V, Urbach S, Samain S, Bergoin M, Wincker P, Demettre E, Cousserans F, Provost B, Coulibaly F, Legeai F, Béliveau C, Cusson M, Gyapay G, Drezen JM. Analysis of virion structural components reveals vestiges of the ancestral ichnovirus genome. PLoS Pathog. 2010. 6:e1000923. PubMed PMID:20523890; PubMed Central PMCID: PMC2877734.

10. Abi Khattar Z, Rejasse A, Destoumieux-Garzón D, Escoubas JM, Sanchis V, Lereclus D, Givaudan A, Kallassy M, Nielsen-Leroux C, Gaudriault S. The dlt operon of Bacillus cereus is required for resistance to cationic antimicrobial peptides and for virulence in insects. J Bacteriol. 2009. 191:7063-73.

11. Bézier A, Annaheim M, Herbinière J, Wetterwald C, Gyapay G, Bernard-Samain S, Wincker P, Roditi I, Heller M, Belghazi M, Pfister-Wilhem R, Periquet G, Dupuy C, Huguet E, Volkoff AN, Lanzrein B, Drezen JM. Polydnaviruses of braconid wasps derive from an ancestral nudivirus. Science. 2009. 323:926-30.

12. Destoumieux-Garzon D, Brehelin M, Bulet P, Boublik Y, Girard PA, Baghdiguian S, Zumbihl R, Escoubas JM. Spodoptera frugiperda X-tox protein, an immune related defensin rosary, has lost the function of ancestral defensins. PloS One. 2009. 4(8), e6795.

13. Jubelin G, Varela Chavez C, Taieb F, Banfield MJ, Samba-Louaka A, Nobe R, Nougayrède JP, Zumbihl R, Givaudan A, Escoubas JM, Oswald E. Cycle inhibiting factors (CIFs)are a growing family of functional cyclomodulins present in invertebrate and mammal bacterial pathogens. PLoS One. 2009. 4(3):e4855.

14. Serbielle C, Moreau S, Veillard F, Voldoire E, Bézier A, Mannucci MA, Volkoff AN, Drezen JM, Lalmanach G, Huguet E. Identification of parasite-responsive cysteine proteases in Manduca sexta. Biol Chem. 2009. 390:493-502.

15. Vendeville A, Ravallec M, Jousset FX, Devise M, Mutuel D, López-Ferber M, Fournier P, Dupressoir T, Ogliastro M. Densovirus infectious pathway requires clathrin-mediated endocytosis followed by trafficking to the nucleus. J Virol. 2009. 83:4678-89.
Budget annuel total
2008
Budget annuel total (k€ - excluant les salaires)
428 000
Contrats externes (k€) :


ANR
82 000
UE

Secteur privé
131 000
Autres
428 000