Communauté scientifique de Montpellier



Ecologie Fonctionnelle & Biogéochimie des Sols (ECO&SOLS)

Directeur: Jean-Luc Chotte
   
Thématique de recherche
 
Les travaux de l'Unité Mixte de Recherche «Eco&Sols» portent sur l'étude du rôle des micro-organismes des plantes et du sol dans le fonctionnement des agro-écosystèmes, et principalement dans les cycles biogéochimiques du carbone et des nutriments (en particulier azote et phosphore) dans le cadre d'une agriculture raisonnée et dans les plantations forestières des zones Méditerranéennes et tropicales. Le but est d'appliquer ces nouvelles connaissances en mettant en place des stratégies innovantes de gestion écologique de ces agro-systèmes, tout en tenant compte des facteurs majeurs responsables des changements globaux (changement climatique et changement dans l'utilisation des terres)
 
Points forts de la recherche
 

Une expertise unique, reconnue internationalement, dans les domaines suivants : L'écologie fonctionnelle du sol la biogéochimie des zones de forte activité biologique dans les sols, comme la rhizosphère, la drilosphère, la termitosphère la séquestration du carbone dans les sols à différents niveaux (from molecular processes of protection of soil organic matter, to regional balances of soil C) Les cycles de nutriments et la mesure/la modélisation des flux au niveau de l'écosystème, ainsi qu'au niveau de la plante ou de la racine.

 
Personnel
Instituts
Chercheurs
Professeurs
Ingénieurs de recherche
Personnel administratif et technique
Doctorants
Mtp SupAgro, IRD, INRA, Cirad 40 3 6

23

31
           
Equipes de recherche
  • Réseaux d'interactions biologiques [personnel permanent: 7]
  • Réactivité et devenir de la matière organique du sol [personnel permanent: 12]
  • Flux des nutriments entre le sol et la plante (azote, phosphore) [personnel permanent: 9]
  • Cycle du carbone et vulnérabilité [personnel permanent: 8] Techniques écologiques et indicateurs de la qualité du sol [personnel permanent: 9]
Plateformes et autres outils
  • L2 - Plateforme des sols tropicaux : laboratoire dédié à la manipulation de sols vivants importés d'autres pays, y compris des pays tropicaux (seulement 2 laboratoires en France sont habilités à mener ce genre de recherches)
  • P2 - Plateforme biochimie des protéines et du sol : laboratoire destiné à mesurer la réactivité de la matière organique et les intéractions sol-protéines du sol (y compris les prions, et le Bt, Bacillus thurengiensis)
  • Expertise en spectroscopie infrarouge (proche et moyen) pour l'étude des propriétés chimiques, biologiques et physiques du sol
  • Plateforme Mesocosme-Microcosme : chambres de culture et serres pour conduire des expériences sur la plante dans des conditions contrôlées (ne convient pas pour la manipulation de sols tropicaux vivants)
  • Plateforme de biologie du sol et d'écologie moléculaire
  • Plateforme physicochimie du sol
Principaux partenariats internationaux
  • GSF, Munich, Allemagne (J.C. Munch et al.)
  • Université de Perth, Australie (H. Lambers et Z. Rengel)
  • BOKU, Vienne, Autriche (W.W. Wenzel)
  • Université du Pays de Galles, Bangor, Royaume Uni (D.L. Jones et D. Godbold)
  • Université de Dakar (Sénégal), Département de Biologie
Faits et chiffres
Publications dans des revues internationales
2008: 44
2007: 49
2006: 40
2005: 32

Publications significatives
  1. Ali M.A., Louche J., Legname E., Duchemin M., Plassard C. 2009. Pinus pinaster seedlings and their fungal symbionts show high plasticity in phosphorus acquisition in acidic soils. Tree Physiology, 29, 1587-1597.
  2. van Aarle I.M., Viennois G., Amenc L.K., Tatry M.V., Luu D.T., Plassard C. 2007. Fluorescent in situ RT-PCR to visualise the expression of a phosphate transporter gene from an ectomycorrhizal fungus. Mycorrhiza, 17, 487-494.
  3. Louche, J., Ali M.A., Cloutier-Hurteau B., Sauvage F.-X., Quiquampoix H., Plassard C., 2010. Efficiency of acid phosphatases secreted from the ectomycorrhizal fungus Hebeloma cylindrosporum to hydrolyse organic phosphorus in podzols. FEMS Microbiology Ecology, 73: 323-335.
  4. Beer C., Reichstein M., Tomelleri E., Ciais P., Jung M., Carvalhais N., Rodenbeck C., Arain M.A., Baldocchi D., Bonan G.B., Bondeau A., Cescatti A., Lasslop G., Lindroth A., Lomas M., Luyssaert S., Margolis H., Oleson K.W., Roupsard O., Veenendaal E., Viovy N., Williams C., Woodward F.I. and Papale D., 2010. Terrestrial gross carbon dioxide uptake: Global distribution and covariation with climate. Science, 329 : 834-838.
  5. Bernard L., Mougel C., Maron P.A., Nowak V., Leveque J., Henault C., Haichar F.E.Z., Berge O., Marol C., Balesdent J., Gibiat, F. Lemanceau, P. & Ranjard L. 2007. Dynamics and identification of soil microbial populations actively assimilating carbon from C-13-labelled wheat residue as estimated by DNA- and RNA-SIP techniques. Environmental Microbiology, 9, 752-764.
  6. Blanchart E., Marilleau N., Chotte J-L., Drogoul A., Perrier E. & Cambier C. 2009. Sworm : an agent based model to simulate the effect of earthworms on soil structure. European Journal of Soil Science, 60: 13-21.
  7. Bonkowski M., Villenave C., Griffiths B. 2009. Rhizosphere fauna: the functional and structural diversity of intimate interactions of soil fauna with plant roots. Plant and soil, 321: 213-233.
  8. Bouillet J.P., Laclau J.P., Gonçalves J.L.M., Moreira M.Z., Trivelin P., Jourdan C., Galiana A., 2008. Mixed-species plantations of Acacia mangium and Eucalyptus grandis in Brazil. 2. Nitrogen accumulation in the stands and biological N2 fixation. Forest Ecology and Management 255: 3918-393.
  9. Bravin M.N., Tentscher P., Rose J. & Hinsinger P. 2009. Rhizosphere pH Gradient Controls Copper Availability in a Strongly Acidic Soil. Environmental Science & Technology, 43, 5686-5691.
  10. Chapuis-Lardy L., Metay A., Martinet M., Rabenarivo M., Toucet J., Douzet J.M., Razafimbelo T, Rabeharisoa L. & Rakotoarisoa J. 2009. Nitrous oxide emissions from Malagasy agricultural soils. Geoderma, 148: 421-427.
  11. Chapuis-Lardy L., Wrage N., Metay A., Chotte J.L., Bernoux M. 2007. Soils, a sink for N2O ? A review. Global Change Biology, 13, 1-17.
  12. Devau N., Le Cadre E., Hinsinger P. & Gerard F. 2010. A mechanistic model for understanding root-induced chemical changes controlling phosphorus availability. Annals of Botany, 105, 1183-1197.
  13. Epron D., Nouvellon Y., Deleporte P., Ifo S., Kazotti G., Thongo M'Bou A., Mouvondy W., Saint-Andre L., Roupsard 0., Jourdan C., Hamel O., 2006. Soil Carbon balance in a clonal Eucalyptus plantation in Congo: effects of logging on carbon inputs and soil CO2 efflux. Global Change Biology, 12: 1021-1031.
  14. Hergoualc'h K., Skiba U., Harmand JM., Hénault C., 2008. Fluxes of greenhouse gases from Andosols under coffee in monoculture or shaded by Inga densiflora in Costa Rica. Biogeochemistry,89: 329-345.
  15. Hinsinger P., Bengough A.G., Vetterlein D., Young I.M. 2009. Rhizosphere: biophysics, biogeochemistry and ecological relevance. Plant and Soil, 321: 117-152.
  16. Jung, M., M. Reichstein, Ciais P., Seneviratne S.I., Sheffield J., Goulden M.L., Bonan G., Cescatti A., Chen J., de Jeu R., Dolman A.J., Eugster W., Gerten D., Gianelle D., Gobron N., Heinke J., Kimball J., Law B.E., Montagnani L., Mu Q., Mueller B., Oleson K., Papale D., Richardson A.D., Roupsard O., Running S., Tomelleri E., Viovy N., Weber U., Williams C., Wood E., Zaehle S., Zhang K., 2010 . Recent decline in the global land evapotranspiration trend due to limited moisture supply. Nature, 467 (7318): 951-954.
  17. Luyssaert S., Jung M., Richardson A.D., Reichstein M., Papale D., Piao S.L., Schulze E.-D., Wingate L., G. Matteucci, L. Aragao, M. Aubinet, C. Beer, C. Bernhofer, K.G. Black, D. Bonal, J.-M. Bonnefond, J.Chambers, P. Ciais, B. Cook, K.J. Davis, A.J. Dolman, B. Gielen, M. Goulden, J. Grace, A. Granier, A. Grelle, T. Griffis, T. Grünwald, G. Guidolotti, P.J. Hanson, R. Harding, D.Y. Hollinger, L.R. Hutyra, P. Kolari, B. Kruijt, W., Kutsch, F. Lagergren, T. Laurila, B.E. Law, Le Maire G., A. Lindroth, D. Loustau, Y. Malhi, J. Mateus, M. Migliavacca, L. Misson, L. Montagnani, J. Moncrieff, E. Moors, J.W. Munger, E. Nikinmaa, Ollinger S.V., Pita G., Rebmann C., Roupsard O., Saigusa N., Sanz M.J., Seufert G., Sierra C., Smith M.-L., Tang J., Valentini R., Vesala T., Janssens I.A., 2007. The CO2-balance of boreal, temperate and tropical forests derived from a global database. Global Change Biology, 13: 2509-2537.
  18. Marsden C., Nouvellon Y., Thongo M'Bou A., Saint-André L., Jourdan C., Kinana A., Epron D. 2008. Two independent estimations of stand-level root respiration on clonal Eucalyptus stands in Congo: up scaling of direct measurements on roots versus the trenched-plot technique. New Phytologist, 177: 676-687.
  19. Raynaud X., Jaillard B., Leadley P.W. 2007. Can the change of nutrient bioavailability by plants in rhizosphere alter competition for resources? A modelling approach. American Naturalist, 171: 44-58.
  20. Tatry M.V., El Kassis E., Lambilliotte R., Corratgé C., van Aarle I., Amenc L.K., Alary R., Zimmermann S., Sentenac H., Plassard C. 2009. Two differentially regulated phosphate transporters from the symbiotic fungus Hebeloma cylindrosporum and phosphorus acquisition by ectomycorrhizal Pinus pinaster. The Plant Journal 57: 1092-1102.