Communauté scientifique de Montpellier



Laboratoire d’écophysiologie des plantes sous stress environnementaux (LEPSE)

Directeur : Thierry SIMONNEAU

Thématique de recherche
Les recherches de l'UMR LEPSE, Laboratoire d'écophysiologie des plantes sous stress environnementaux, concernent principalement la caractérisation de la variabilité génétique existante des réponses au déficit hydrique afin de concevoir la construction de génotypes ayant des stratégies contrastées et adaptées à des milieux présentant différents niveaux de contraintes (expliquer les réponses des génotypes en termes quantitatifs, analyser la variabilité génétique de ces réponses, - reconstruire in silico le comportement des génotypes).
Points forts de la recherche
  • Développement de méthodologies de phénotypage pour disséquer et modéliser les réponses de la plante entière (croissance foliaire et racinaire, utilisation de l'eau) face aux changements climatiques.
  • Détection de QTLs (maïs, Arabidopsis) ou de caractères héritables (tournesol, vigne) favorables au maintien du rendement en situation de stress abiotique. Quantification de l'impact de la diversité allélique sur les caractères cibles.
  • Association de la génétique et de la modélisation écophysiologique, pour simuler le comportement de génotypes virtuels dans différents scénarii climatiques.
Personnel
Agents permanents
Chercheurs*
Chercheurs avec HDR**
Post-doctorants
Doctorants
28
13
3
5
8
*Nombre de chercheurs par institut : 10 INRA, 3 Montpellier SupAgro
**HDR : Habilitation à diriger des recherches
Equipes de recherche
  • Modélisation et Analyse de l'interaction Génotype Environnement - MAGE
  • Modélisation et Analyse du Phénotype Intégré des plantes - MAPI
  • Stress environnementaux et Processus Intégrés du contrôle de la Croissance - SPIC
Plateformes et autres outils
Plateforme de phénotypage PHENODYN et automates PHENOPSIS (serres et chambres de culture) pour mesurer en continu le taux de croissance foliaire, le taux de transpiration, la photosynthèse, la température de la feuille (imagerie infrarouge) en réponse aux changements de statut hydrique du sol et aux variables micro-météorologiques (jusqu'à 400 plantes «agronomiques» comme le maïs pour la plateforme PHENODYN; jusqu'à 1500 plantes de petites taille comme Arabidopis dans les automates PHENOPSIS).
Outils mathématiques et informatiques permettant l'analyse architecturale du développement foliaire et racinaire de la plante, dissection des interactions entre la représentation informatique des plantes et les facteurs climatiques, et simulation des réponses de la plante à l'environnement.
Principaux partenariats internationaux
Generation Challenge Programme (GCP) = 2 programmes de recherche en collaboration avec des centres de recherche internationaux (IRRI, CIMMYT, CIRAD), des universités (Queensland, Australie) et des programmes nationaux (Kenya et Inde)
UE : Integrated project Agron-Omics = 14 partenaires dont les plus importants laboratoires de l'UE (ETH Zurich, PSB Gand, MPI Gölm, UMH Alicante ; JIC Norwhich, NASC Nottingham,...) travaillant sur les contrôles moléculaire et cellulaire de la croissance foliaire sur le modèle Arabidosis (LEPSE coordonne un «Work-Package»)
Faits et chiffres
Publications dans des revues internationales
2007 : 12
2006 : 14
Publications significatives
Chenu K, Franck N, Lecoeur J (2007) Simulations of virtual plants reveal a role for SERRATE in the response of leaf development to light in Arabidopsis thaliana. New Phytol. 175(3):472-481

Muller B et al. (2007) Association of specific expansions with longitudinal and lateral expansion in maize leaves is maintained under environmental, genetic and developmental sources of variation. Plant Physiol. 143(1):278-290

Hammer G, Cooper M, Tardieu F, Welch S, Walsh B, van Eeuwijk F, Chapman S, Podlich D (2006) Models for navigating biological complexity in breeding improved crop plants. Trends Plant Sci. 11(12):587-593

Granier C et al. (2006) PHENOPSIS an automated platform for reproducible phenotyping of plant responses to soil water deficit in Arabidopsis thaliana permitted the identification of an accession with low sensitivity to soil water deficit. New Phytol. 169(3):623-635

Lydie Guilioni, Jean-Paul Lhomme (2006) Modelling the daily course of capitulum temperature in a sunflower canopy. Agr. Forest Meteorol. 138(1-4):258-272

Dosio GAA, Tardieu F, Turc O (2006) How does the meristem of sunflower capitulum cope with tissue expansion and floret initiation? A quantitative analysis. New Phytol. 170(4):711-722