Communauté scientifique de Montpellier



Laboratoire de Protéomique Fonctionnelle

Directeur : Michel Rossignol

Thématique de recherche
Le Laboratoire de Protéomique Fonctionnelle (LBF) est une unité de recherche INRA spécialisée en protéomique, une discipline moléculaire récente qui permet l'étude de l'ensemble des protéines actives dans la cellule, en aval de l'expression du génome. Au-delà de la caractérisation des protéines dans un contexte physiologique donné, l'accent est placé sur les modifications réversibles qui déterminent la fonction des protéines. Le LPF s'intéresse principalement aux signaux post-traductionnels liés aux fluctuations de l'environnement chez les plantes, dans le but d'intégrer les connaissances concernant le réseau des évènements post-traductionnels qui conduisent au final à la réponse (au niveau moléculaire) aux stress abiotiques.
Ces approches quantitatives bénéficient de la plate-forme de protéomique en spectrométrie de masse IBiSA hébergée par l'unité et sont associées à des études de physiologie moléculaire au travers de collaborations.
Points forts de la recherche
  • Méthylation des aquaporines dans la membrane plasmique de la plante
  • Analyse protéomique des protéines phosphorylées
  • Identification de sites de phosphorylation dans les transporteurs actifs secondaires dans de nouveaux sous-ensembles de phosphoprotéomes du plasmalemme d'Arabidopsis
Personnel
Agents permanents
Chercheurs*
Chercheurs avec HDR**
Post-doctorants
Doctorants
12
7
1
02
15
* Répartition des chercheurs par institut : 7 INRA
** HDR : habilitation à diriger des recherches

  
Equipes de recherche
  • Nitrosylation des protéines
  • Phosphorylation des protéines
  • Etiquetage des protéines par Ub et par polypeptides SUMO
  • Plate-forme d'analyse protéomique
Plateformes et autres outils
Plate-forme d'analyse protéomique : robotique, spectrométrie de masse, bioinformatique
Principaux partenariats internationaux
- Programme UE GVE, terminé en 2005 (Belgique, Allemagne, Grande-Bretagne)
- Programme ERA-PG ProteinStorage (Allemagne, Espagne)
- Collaborations bilatérales (Tchéquie, Italie, Irlande, Portugal, Pologne)
Faits et chiffres
Publications dans des revues internationales
2007 : 8
2006 : 7
2005 : 6
Publications significatives
Chevalier F, Martin O, Rofidal V, Devauchelle AD, Barteau S, Sommerer N, Rossignol M (2004) Proteomic investigation of natural variation between Arabidopsis ecotypes. Proteomics, 4, 1372-1381.

Nacry P, Canivenc G, Muller B, Azmi A, Van Onckelen H, Rossignol M, Doumas P (2005) A Role for Auxin Redistribution in the Responses of the Root System Architecture to Phosphate Starvation in Arabidopsis. Plant Physiol., 138, 2061-2074.

Chevalier F, Centeno D, Rofidal V, Tauzin M, Martin O, Sommerer N, Rossignol M (2006) Different Impact of Staining Procedures Using Visible Stains and Fluorescent Dyes for Large-Scale Investigation of Proteomes by MALDI-TOF Mass Spectrometry. J. Proteome Res., 5, 512-520.

Faurobert M, Mihr C, Bertin N, Pawlowski T, Negroni L, Sommerer N, Causse M (2007) Major Proteome Variations Associated with Cherry Tomato Pericarp Development and Ripening. Plant Physiol., 143, 1327-1346.

Segonzac C, Boyer JC, Ipotesi E, Szponarski W, Tillard P, Touraine B, Sommerer N, Rossignol M, Gibrat R (2007) Nitrate Efflux at the Root Plasma Membrane: Identification of an Arabidopsis Excretion Transporter Plant Cell, 19, 3760-3777.