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Directeur: Michel Lebrun
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Site Web:
http://www.mpl.ird.fr/lstm/ |
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Thématique de recherche
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Le Laboratoire des symbioses tropicales et méditerranéennes (LSTM) est une unité de biologie et de microbiologie des plantes spécialisée dans l'analyse de la biodiversité et des mécanismes fonctionnels des microorganismes symbiotiques et de la réponse des plantes aux microorganismes et aux conditions environnementales défavorables. La recherche au LSTM est axée sur les symbioses des rhizobiums / légumineuses et des plantes / mycorhizal. Les recherches fondamentale et appliquée du LSTM sont principalement dédiées aux zones méditerranéennes et tropicales où les plantes / micro-organismes symbiotiques peuvent jouer un rôle crucial dans la production et la foresterie agronomiques ainsi que dans la restauration des environnements menacés, en particulier dans les pays du Sud.
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Points forts de la recherche
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Les objectifs scientifiques du LSTM comprennent les recherches fondamentale et appliquée sur la biologie, l'écologie et l'utilisation des symbioses plantes-microorganismes dans les zones tropicales et méditerranéennes. Pendant ces dernières années, les résultats majeurs du LSTM tels que la découverte de la symbiose beta-protéobactéries, de la symbiose NOD-indépendante entre le Rhizobium photosynthétique et les plantes tropicales, et plus généralement diverses études faisant référence à la diversité bactérienne et aux relations entre plantes, bactéries et champignons dans divers systèmes écologiques, ont contribué à la construction d'une identité internationale forte du laboratoire.
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Personnel
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Instituts
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Chercheurs
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Professeurs
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Ingénieurs de recherche
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Personnel administratif et technique |
Doctorants
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IRD, Cirad, INRA, Mtp SupAgro, UM2
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21
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7
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6
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11
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9
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Equipes de recherche
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- Mécanismes de symbiose Nod-indépendante
- Diversité et adaptation du Rhizobium à la symbiose
- Adaptation des micro-organismes et de la symbiose aux contraintes du sol
- Symbiose et résilience des écosystèmes
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Principaux partenariats internationaux
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- Laboratoire de Microbiologie, Université Cheikh Anta Diop, ISRA, Dakar, Sénégal
- Laboratoire de Rhizobiologie, Université d'Oran Es-Senia, Algérie
- Laboratoire Mixte International, Université Mohamed V, Rabat, Maroc
- Institut de Chimie Bioorganique, Poznan, Pologne
- Institut écossais de recherche sur les cultures, Dundee, UK
- Laboratoire d'agrobiologie, Embrapa, Seropedica, Brésil
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Faits et chiffres
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Publications dans des revues internationales
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2005 - 2010: 141
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Publications significatives
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1. Ahlgren, N.A., Harwood, C.S., Schaefer, A.L., Giraud, E., Greenberg, E.P. (2011). Aryl-homoserine lactone quorum sensing in stem-nodulating photosynthetic bradyrhizobia.PNAS. 108: 7183-7188.
2. Bailly, X., Olivieri, I., Brunel, B., Cleyet-Marel, J.C., Béna, G. (2007). Horizontal gene transfer and homologous recombination drive the evolution of the nitrogen-fixing symbionts of Medicago species. J Bacteriol. 189: 5223-5236.
3. Bailly, X., Olivieri, I., De Mita, S., Cleyet-Marel, J.C., Béna, G. (2006). Recombination and selection shape the molecular diversity pattern of nitrogen-fixing Sinorhizobium sp. associated to Medicago. Mol Ecol. 15: 2719-2734.
4. Bonaldi, K., Gherbi, H., Franche, C., Bastien, G., Fardoux, J., Barker, D., Giraud, E., Cartieaux, F. (2010). The Nod factor-independent symbiotic signaling pathway: development of Agrobacterium rhizogenes-mediated transformation for the legume Aeschynomene indica. Mol Plant Microbe Interact. 23(12):1537-44.
5. Cartieaux, F., Contesto, C., Gallou, A., Desbrosses, G., Kopka, J., Taconnat, L., Renou, J.P., Touraine, B. (2008). Simultaneous interaction of Arabidopsis thaliana with Bradyrhizobium sp. ORS278 and Pseudomonas syringae pv tomato DC3000 leads to complex transcriptome changes. Mol Plant Microbe In. 21: 244-259.
6. de Faria, S.M., Diedhiou, A.G., de Lima, H.C., Ribeiro, R.D., Galiana, A., Castilho, A.F., Henriques, J.C. (2010). Evaluating the nodulation status of leguminous species from the Amazonian forest of Brazil. J. Exp. Bot. 61: 3119-3127
7. Demanèche, S., Sanguin, H., Poté, J., Navarro, E., Bernillon, D., Mavingui, P., Wildi, W., Vogel, T.M., Simonet, P. (2008). Antibiotic-resistant soil bacteria in transgenic plant fields. P Natl Acad Sci USA. 105: 3957-3962.
8. Ducousso, M., Ramanankierana, H., Duponnois, R., Rabevohitra, R., Randrihasipara, L., Vincelette, M., Dreyfus, B., Prin Y. (2008). Mycorrhizal status of native trees and shrubs from eastern Madagascar littoral forests with special emplasis on one new ectomycorrhizal endemic family, the Asteropeiaceae. New Phytol. 178: 233-238.
9. Giraud E, Fardoux J, Fourrier N, Hannibal L, Genty B, Bouyer P, Dreyfus B, Verméglio A. (2002) Bacteriophytochrome controls photosystem synthesis in anoxygenic bacteria. Nature 417:202-205.
10. Giraud E., Moulin L., D. Vallenet, V. Barbe, E. Cytryn, J-C. Avarre, M. Jaubert, D. Simon, F. Cartieaux, Y. Prin, G. Bena, L. Hannibal, J. Fardoux, M. Kojadinovic, L. Vuillet, A. Lajus, S. Cruveiller, Z. Rouy, S. Mangenot, B. Segurens, C. Dossat, W. L. Franck, W-S. Chang, E. Saunders, D. Bruce, P. Richardson, P. Normand, B. Dreyfus, D. Pignol, G. Stacey, D. Emerich, A. Vermeglio, C. Medigue, And M. Sadowsky. (2007). Legumes Symbioses: Absence of Nod Genes in Photosynthetic Bradyrhizobia. Science 316: 1307-1312
11. Gyaneshwar, P., Hirsch, A.M., Moulin, L., Chen, W.M., Elliott, G.N., Bontemps, C., Estrada de Los Santos, P., Gross, E., Dos Reis Junior, F.B., Sprent, J., Young, P.W., James, E.K.. (2011). Legume-nodulating betaproteobacteria: diversity, host range and future prospects. Mol Plant Microbe Interact.
12. Héry, M., Philippot, L., Mériaux, E., Poly, F., Le Roux, X., Navarro, E. (2005). Nickel mine spoils revegetation attempts : Effect of pioneer plants on two functional bacterial communities involved in the N cycle. Environ Microbiol. 4: 486-498.
13. Jourand P, Ducousso M, Loulergue-Majorel C, Hannibal L, Santoni S, Prin Y, Lebrun M. (2010) Ultramafic soils from New Caledonia structure Pisolithus albus in ecotype. FEMS Microbiol Ecol. 72 :328-349.
14. Laguerre, G., Depret, G., Bourion, V., Duc, G. (2007). Rhizobium leguminosarum biovar viciae genotypes interact with pea plants in developmental responses of nodules, roots and shoots. New Phytol. 100: 589-598.
15. Le Roux, C., Tentchev, D., Prin, Y., Goh, D., Japarudin, Y., Perrineau, M.M., Duponnois, R., Domergue, O., de Lajudie, P., Galiana, A. (2009).Bradyrhizobia Nodulating the Acacia mangium x A. auriculiformis Interspecific Hybrid Are Specific and Differ from Those Associated with Both Parental Species.Applied and Environmental Microbiology, 75(24): 7752-7759
16. Mahieu, S., Frérot, H., Vidal, C., Galiana, A., Heulin, K., Maure, L., Brunel, B., Lefèbvre, C., Escarré, J., Cleyet-Marel, J.C. (2011). Anthyllis vulneraria - Mesorhizobium metallidurans, an efficient symbiotic nitrogen-fixing association able to grow in mine tailings highly contaminated by Zn, Pb and Cd. Plant Soil. 342: 405-417.
17. Masson-Boivin, C., Giraud, E., Perret, X. Batut, J. (2009). Establishing nitrogen-fixing symbiosis with legumes: how many rhizobium recipes? Trends Microbiol. 17(10): 458-466.
18. Pillon Y., Munzinger J., Amir H., Lebrun M. (2010) Ultramafic soils and species sorting in the flora of New Caledonia. J. Ecology 98:1108-116.
19. Remigi, P., Faye, A., Kane, A., Deruaz, M., Thioulouse, J., Cisoko, M., Prin, Y., Galiana, A., Dreyfus, B., Duponnois, R. (2008). The exotic legume tree species Acacia holosericea alters microbial soil functionalities and the structure of the arbuscular mycorrhizal community. Appl Environ Microb. 74: 1485-1493.
20. Vuillet, L., Kojadinovic, M., Zappa, S., Jaubert, M., Adriano, J.M., Fardoux, J., Hannibal, L., Pignol, D., Verméglio, A. and Giraud, E. (2007) Evolution of a bacteriophytochrome from light to redox sensor. EMBO J. 6:3322-31
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| Budget annuel total | |||||
| 2008 | 2009 | 2010 | |||
| Budget annuel total (k€ - excluant les salaires) | 608 466 | 535 559 | 685 069 | ||
| Contrats externes (k€) : | |||||
| ANR |
144 868 |
191 362 |
201 312 |
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| UE |
32 000 |
20 000 |
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| Secteur privé | 12 000 |
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| Autres | 13 262 | 5 000 | 50 000 | ||