Communauté scientifique de Montpellier



Mathématiques, Informatique et Statistique pour l'Environnement et l'Agronomie (MISTEA)

Directeur: Alain Rapaport
rapaport@supagro.inra.fr
Thématique de recherche
Les activités de l'Unité mixte de recherche MISTEA sont axées sur le développement de méthodes mathématiques, statistiques et informatiques pour l'analyse et l'aide à la décision dans les systèmes liés à l'agronomie et l'environnement, avec un accent particulier sur la modélisation, l'analyse et la simulation de systèmes dynamiques et complexes. Cela peut prendre la forme d'applications destinées à l'écologie microbienne, aux ressources renouvelables, aux systèmes de production agronomique avec leurs interactions avec l'environnement, et aux bioprocédés alimentaires.
Points forts de la recherche
Modélisation multi-échelle de biofilms microbiens
Effet de structures spatiales sur les performances et la stabilité des écosystèmes microbiens et des bioréacteurs
Stratégie optimale pour la biorestauration des ressources en eau
Méthodes de gestion des données et des connaissances pour les systèmes complexes
Statistiques fonctionnelles pour l'analyse multi-échelle des données
Personnel
Institution Chercheurs Professeurs Ing. de recherche Personnel Adm. et Techn. Doct.s
MTP SUPAGRO - INRA
8
3
2
5
6
Equipes de recherche
L'unité est structurée en deux équipes. L'une est MODEMIC (Modelling and Optimisation of the Dynamics of Ecosystems with MICro-organisms), traitant des sujets tels que les écosystèmes, l'écologie microbienne, la dynamique des populations et la conservation des ressources et s'occupant du développement, de l'analyse et de la simulation de modèles spatio-temporels et individu-centrés; l'optimisation, la théorie du contrôle, l'estimation et de filtrage. La deuxième équipe, GAMMA (manaGement and Analysis of Mass data from Agronomics and environmental processes) travaille sur des sujets liés à la gestion durable des plantes et des arbres ainsi qu'à la gestion des processus de la transformation alimentaire et environnementaux. Elle est impliquée dans la représentation des connaissances, le raisonnement flou, l'ontologie et la gestion des données.
Plateformes et autres outils
MODEMIC est une équipe conjointe avec INRIA Sophia-Antipolis Méditerranée
Principaux partenariats internationaux
CESAME Belgique, CEES Pays-Bas, Stanford USA, McGill Canada, CMM Chili, UTFSM Chili, IMCA Pérou, EMBRAPA Brésil , Univ. Fianarantsoa Madagascar. Wageningen UR Pays Bas.
Faits et chiffres
Publications dans des revues internationales
2005 - 2009: 81

Publications significatives
1. Dumont, M., Harmand, J., Rapaport, A. and Godon, J.J, 2009. Toward functional molecular fingerprints. Environmental Microbiology, 11 (7), pp. 1717-1727.

2. Jeanson, S., Hilgert, N. Coquillard, M.O., Seukpanya, C., Faiveley, M., Neveu, P., Abraham, C., Georgescu, V., Fourcassié, P. and Beuvier E., 2009. Milk acidification by Lactococcus lactis is improved by decreasing the level of dissolved oxygen rather than decreasing redox potential in the milk prior to inoculation. Int. J. of Food Microbiology, 131 (1), pp. 75-81.

3. Goelzer A., Charnomordic B., Colombié S., Fromion V., Sablayrolles J.M., 2009. Simulation and optimization software for alcoholic fermentation in winemaking conditions. Food Control, 20, 635-642.

4. Piazza, A. and Rapaport, A., 2009. Optimal Control of Renewable Resources with Alternative Use. Mathematical and Computer Modelling. Vol. 50 (1--2), pp. 260-272,

5. Rapaport, A., Dochain, D. and Harmand, J., 2009. Long run coexistence in the chemostat with multiple species, J. Theoretical Biology, 257, 2, 252-259.

6. Thomopoulos R., Charnomordic B., Cuq B., Abécassis J., 2009. Artificial Intelligence-Based Decision Support System to Manage Quality of Durum Wheat Products. International Association for Cereal Science and Technology, Vol. 1, No. 3.

7. Grechi, I., Hilgert, N., Genard, M. and Lescourret, F.,2008. Assessing peach fruit refractometric index at harvest with a simple model based on fruit growth, J. Amer. Soc. Hort. Sci., 133, 2, 178-187.

8. Grechi, I., Sauge, M.H., Sauphanor, B., Hilgert, N., Senoussi, R. and Lescourret, F., 2008. How does winter pruning affect peach tree - Myzus persicae interactions, Entomologia Experimentalis et Applicata, 128, 3, 369-379, 2008.

9. Haegeman B. and Loreau M. 2008 Limitations of entropy maximization in ecology, Oikos 117, 1700-1710.

10. B. Haegeman, J.Hamelin , J.J. Godon, J. Harmand and P. Loisel., 2009. A method for measuring the biological diversity of a sample, Europen Patent N° WO 2009/053393.

11. Haegeman B., Vanpeteghem D., Godon J.-J., Hamelin J., 2008. DNA reassociation kinetics and diversity indices: Richness is not rich enough, Oikos 117, 177-181.

12. Gaucherel, C., Campillo, F., Misson, L., Guiot, J., Boreux, J.-J., 2008. Parameterization of a process-based tree-growth model: comparison of optimization, MCMC and particle filtering algorithms. Environmental Modelling and Software, 23(10-11), 1280-1288.

13. Harmand, J., Rapaport, A., Dochain, D., Lobry, C., 2008. Microbial ecology and bioprocess control : Opportunities and challenges. Journal of Process Control. 2008, 18 (9) : 865-875.

14. Vanpeteghem D., Zemb O., Haegeman B., 2008. Dynamics of neutral biodiversity, Mathematical Biosciences 212, 88-98.

15. Harmand J., Lobry C., Rapaport A. et Godon J.-J., 2006, La modélisation des écosystèmes microbiens : une nécessité pour la recherche et l'industrie. Dossier Ecologie microbienne des sols, Biofutur, No. 268, pp. 54-57.

16. Loisel P., Harmand J., Zemb O., Latrille E., Lobry C., Delgenès J.Ph. and Godon J.J., 2006. Denaturing gradient electrophoreses (DGE) and single-strand conformation polymorphism (SSCP) molecular fingerprintings revisited by simulation and used as a tool to measure microbial diversity. Environmental Microbiology, 8 (4), pp. 720-731.
Liste de logiciels développés par l'Unité
FISPRO, SOFA, VITELBIO, SILEX
Budget annuel total
2008
2009
2010
Budget annuel total (k€ - excluant les salaires)
109 000
169 000
187 000
Contrats externes (k€) :


ANR
4 000
4 400
50 400
UE
53 100
37 700
Secteur privé

Autres
26 000
80 000