Communauté scientifique de Montpellier



Résistance des plantes aux bioagresseurs (RPB)

Director: Michel NICOLE
Thématiques de recherche
La protection des plantes cultivées contre les stress biotiques est un facteur important pour le développement d'une agriculture durable. Pour les pays tropicaux, l'objectif majeur est de:
  • Réduire l'utilisation des pesticides pour répondre à des priorités écologiques, économiques et de santé humaine
  • Modifier les pratiques culturales en raison du changement climatique
  • Prévenir l'émergence de nouvelles maladies
  • Préserver les ressources phytogénétiques de la dégradation des écosystèmes naturels
Améliorer la durabilité de la résistance des plantes implique un large éventail de procédures, incluant des contrôles agronomiques, biologiques, chimiques ou génétiques, utilisés dans la lutte intégrée contre les ravageurs. L'évaluation de la longévité de la résistance a lieu à trois niveaux: le gène, le génotype et la population. Pour améliorer la durabilité, il est important d'accroître nos connaissances (i) sur la diversité des gènes de résistance (ii) sur les mécanismes de défense qui sous-tendent les interactions plante-parasite, y compris ceux impliqués dans l'affaiblissement de la résistance des plantes. Le projet scientifique de l'unité est d'élaborer des outils et des méthodes qui permettront le transfert de gènes de résistance dans les plantes cultivées.
Points forts de la recherche
Le contrôle génétique des maladies des plantes repose sur l'amélioration ou la création de variétés cultivées en introduisant des gènes de résistance dans des lignées cultivées d'espèces sauvages, avec pour but principal de réduire l'utilisation des pesticides. Cette stratégie résulte en une meilleure connaissance de la biodiversité disponible dans les génotypes, du déterminisme de la résistance, des mécanismes de défense et de la capacité des pathogènes à contourner les gènes de résistance dans les champs. Avec ce continuum «diversité - mécanismes - durabilité de la résistance des plantes», les recherches menées par RPB visent 5 objectifs majeurs:
  • Identifier et caractériser les sources de résistance
  • Démonter les mécanismes de défense des plantes
  • Comprendre l'affaiblissement de la résistance
  • Développer des stratégies pour la gestion des résistances
  • Evaluer et améliorer la durabilité de la résistance des plantes
Personnel
InstitutsChercheursProfesseurs

Ingénieurs de recherche

Personnel administratif et technique

Doctorants
UM2, IRD, Cirad
26
1
5
5
9
Equipes de recherche
Equipe 1 « Diversité génétique et amélioration de la résistance des plantes »
Axe 1 - Biodiversité génétique, adaptation et résistance de Coffea arabica et Musa spp aux pathogènes (rouille, Coffe Berry Disease, nématodes)
Axe 2: Organisation génomique des gènes de résistance du café
Axe 3: Analyse génétique et fonctionnelle des gènes de résistance du café à Meloidogyne exigua et Hemileia vastatrix Axe 4: Introgression et expression du génome

Equipe 2 · «Effecteurs et cibles»
Axe 1: Effecteurs de Xanthomonas oryzae et interaction avec le riz
Axe 2: Effecteurs de Meloidogyne ssp. et résistance du riz aux nématodes
Axe 3: Suppresseurs réprimant l'expression du RYMV

Equipe 3 · «Emergence et Adaptation»
Axe 1: Emergence et adaptation du RYMV en Afrique
Axe 2: Co-émergence de deux virus de riz à transmission propagative
Axe 3: Jaunissement du cocotier
Plateformes et autres outils
  • Plateforme de biologie sur le centre IRD (Genetrop)
  • Accès à différentes plateformes à Montpellier par l'intermédiaire de l'IFR DAPHNE
Most important international partnerships
INERA (Burkina Faso) , Faculté d'Agronomie de Damas (Syrie), Embrapa Cenargen (Brésil), CENICAFE (Colombie), CIFC IICT (Portugal), CARBAP (Cameroun), Kansas State University (USA), WARDA (Bénin), FOFIFA (Madagascar), PPRI (Vietnam), OPRI (Ghana)
Faits et chiffres
Publications dans des revues internationales
2010 : 23
2005 - 2009 : 140
Publications représentatives
1. Gonzalez C., Szurek B., Manceau C., Mathieu T., Séré Y. and Verdier V. 2007. Molecular and pathotypic characterization of new Xanthomonas oryzae strains from West Africa. Molecular Plant-Microbe Interactions, 20 : 534-546.

2. Mahé L, Combes MC and Lashermes P. 2007. Comparison between a coffee single copy chromosomal region and Arabidopsis duplicated counterparts evidenced high level synteny between the coffee genome and the ancestral Arabidopsis genome. Plant Molecular Biology, 69: 699-711.

3. Pinel-Galzi A, Rakotomalala M, Sangu E, Sorho F, Kanyeka Z, Traoré O, Sérémé D, Poulicard N, Rabenantoandro Y, Séré Y, Konaté G, Ghesquière A, Hébrard E and Fargette D. 2007. Theme and variations in the evolutionary pathways to virulence of an RNA plant virus species. PloS Pathogens, 3: e180é.

4. Uzest M, Gargani D, Drucker M, Hébrard E, Gazo E, Candresse T, Fereres A and Blanc S. 2007. A protein key to plant virus transmission at the tip of the insect vector stylet. Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 13: 17959-17964.

5. Weber E, Berger C, Bonas U. and Koebnik R. 2007. Refinement of the Xanthomonas campestris pv. vesicatoria hrpD and hrpE operon structure. Molecular Plant-Microbe Interactions, 20: 559-67.

6. Castiblanco, L., Trujillo, C., Alfonso, N.C., Lopez, C., Szurek, B., Verdier, V., Restrepo, S. and Bernal, A. 2008. Molecular characterization of virulence and pathogenicity determinants in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis. Phytopathology, 98:S32.

7. Chabrier P. and Quénéhervé P. 2008. Preventing nematodes from spreading : a case study with Radopholus similis (Cobb) Thorne on a banana field. Crop Protection, 27 : 1237-1243.

8. Fargette D, Pinel-Galzi A, Sérémé D, Lacombe S, Hébrard H, Traoré O. and Konaté G. 2008. Diversification of Rice yellow mottle virus and related viruses spans the history of agriculture from the Neolithic to the present. PloS Pathogens, 4: e1000125.

9. Mahé L, Combes MC, Várzea VMP, Guilhaumon C. and Lashermes P. 2008. Development of sequence characterized DNA markers linked to leaf rust (Hemileia vastatrix) resistance in coffee (Coffea arabica L.). Molecular Breeding, 21: 105-113.

10. Quilis J. Peñas, G. Messeguer J., Brugidou C. and B. San Segundo 2008. The Arabidopsis AtNPR1 inversely modulates defense responses against fungal, bacterial or viral pathogens while conferring hypersensitivity to abiotic stresses in transgenic rice. Molecular Plant Microbe Interactions, 1:1215-1231.

11. Ventelon-Debout M., Tranchant-Dubreuil C., M. Nguyen, T-T Bangratz-Reyser M, Siré C., Delseny M. and Brugidou C. 2008. Rice yellow mottle virus stress responsive genes from susceptible and tolerant rice genotypes. BMC Plant Biology, 8: 1-12.

12. Champion A., Hébrard E., Parra B., Bournaud C., Marmey M., Tranchant C. and Nicole M. 2009. Analysis of molecular diversity of ERF transcription factors reveals that cotton ERF group IXa members are responsive to jasmonate and Xanthomonas. Molecular Plant Pathology, 10: 471-485.

13. Ramiro D., Escoute J., Petitot A.-S., Nicole M., Maluf M. and Fernandez D. 2009. Biphasic haustorial differentiation of the orange rust Hemileia vastatrix race II associated with differential defense responses in resistant coffee cultivar. Plant Pathology, 58: 944-955.

14. Anthony F, Diniz L, Combes MC and Lashermes P. 2010. Pleistocene radiation in Coffea subgenus Coffea L. (Rubiaceae) in Africa and Madagascar. Plant Systematics and Evolution, 285: 51-64.

15. Bellafiore S. and Briggs S. P. 2010. Nematode effectors and plant responses to infection. Current Opinion in Plant Biology 13: 442-448
Budget annuel total (en Euros)
2008
Budget annuel total
2 423 610
Contrats externes
453 900