Les recherches de l’unité AGAP sont organisées en 3 grands champs thématiques :
- L’analyse et la valorisation de la diversité génétique des agro-écosystèmes et des pratiques humaines de gestion in situ des ressources génétiques, sur des échelles allant du génome à la population
- L’étude des bases génétiques et fonctionnelles des caractères intervenant dans la tolérance aux contraintes abiotiques, la résistance aux maladies et la qualité des produits, intégrant le génotypage et le phénotypage à haut débit et les derniers progrès en analyse fonctionnelle, imagerie et modélisation
- La mobilisation de ces connaissances dans des programmes d’amélioration des plantes menés en partenariat en intégrant la participation des utilisateurs, mettant en oeuvre les derniers outils de la génomique pour augmenter la précision et l’efficacité des différentes étapes de la sélection.
Axes de recherche :
Dynamique de la diversité et domestication - Les enjeux de recherche autour de la diversité génétique des espèces cultivées rejoignent désormais ceux de la protection de la biodiversité dans son acception la plus large qui comprend la préservation des habitats pour les espèces apparentées aux formes domestiques, la nécessité de maintenir et développer des conservatoires ex situ et des actions in situ pour conserver et gérer la diversité actuelle.
Développement et adaptation - Dans un contexte de changement climatique et de contraintes environnementales, les défis sont de contribuer à la stabilisation des rendements des espèces cibles. L’objectif des recherches est de mettre en évidence et de disséquer le contrôle génétique et environnemental de traits d’intérêt de ces espèces.
Génétique et amélioration des plantes - Les avancées de la biologie intégrative, la disponibilité croissante des technologies de génotypage et de phénotypage à haut débit et des outils de simulation ouvrent de nouvelles perspectives pour caractériser les environnements des programmes de création variétale, pour définir des idéotypes de plantes, pour analyser les bases génétiques des caractères quantitatifs impliqués dans l’adaptation des plantes et pour optimiser les schémas de création de matériel innovant.
